Varedo fu scelta come sede di residenza di campagna dalla famiglia Bagatti nel 1523 per sfuggire dalla peste.
Assunse maggiore valore quando gli stravaganti fratelli Fausto e Giuseppe Bagatti Valsecchi costruirono nel 1881 la villa omonima. Ancora oggi conserva, all'interno del giardino, la ricostruzione della porta minore del Lazzaretto di Milano con materiali originali.
Il percorso comprende la visita della Villa, della chiesa dei Santi Pietro e Paolo, sempre progettata da Giuseppe, e la visione di alcune corti storiche a loro legate.